Nach dem 12.Spieltag und dem 1:2 gegen den FC Wil, wurde der Vertrag von Trainer Koller und GC Zürich im gegenseitigen Einvernehmen aufgelöst. Zuvor verpasste GC mit Trainer Koller die Qualifikation zur Champions League nur knapp. Auf einen 1:0 Heimsieg folgte eine 1:3 Auswärtsniederlage bei AEK Athen. Noch unglücklicher agierte das Team im Uefa Cup. Nach einem 1:1 zu Hause und einem 0:0 auswärts gegen Hajduk Split, flog die Koller-Elf, nur wegen der Auswärtstorregel aus dem europäischen Wettbewerb.

Carlos Bernegger übernahm das Zepter von Koller und leitete interimistisch die Geschicke der Stadtzürcher. Koller wurde rund einen Monat später als neuer Trainer beim 1.FC Köln vorgestellt.

Die Winterpause wurde genutzt, um den neuen Trainer Alain Geiger zu installieren.

Auch mit Trainer Geiger kam GC nicht in Fahrt.  Rang sieben am Ende der Saison. Ernüchternd !

Im Schweizer Cup stiess GC bis ins Finale vor.

Im St. Jakobs Park in Basel, verloren die Hoppers den Final nach 2:1 Führung noch mit 2:3 gegen den FC Wil. Die Ostschweizer trafen zweimal vom Punkt.